選擇時要考慮固相萃取柱對分析對象的萃取能力、樣品溶液的體積、洗脫后溶液的終體積等。還要根據樣品溶液中被測物及干擾物的總量選擇合適容量的萃取柱，一般被柱中吸附劑吸附的被測物及干擾物的總質量不應超過吸附物總質量的5%。洗脫劑的體積一般應是萃取柱柱床體積的2-5倍。
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